Según el Estatuto Reformado de la Universidad Nacional de Trujillo, aprobado por Resolución de Asamblea Universitaria Transitoria N° 004-2017-UNT de fecha 11 de diciembre del 2017, en el TÍTULO III DE LA ORGANIZACIÓN, CAPÍTULO VII DE LOS INSTITUTOS DE INVESTIGACIÓN, en el Art. 77° En la Universidad Nacional de Trujillo se consideran los siguientes Institutos Facultativos:

N°	FACULTAD	NOMBRE DEL INSTITUTO	OPERATIVO	RESPONSABLE
01	Ciencias Agropecuarias	Instituto Regional de Investigación Agropecuaria	SI	Dra. Carmen Rosa Rojas Padilla
02	Ciencias Biológicas	Instituto de Investigación en Parasitología y Microbiología	SI	Dr. Franklin Roger Vargas Vásquez
03		Instituto de Investigaciones	NO
04	Ciencias Económicas	Instituto de Investigación y Proyectos de Ciencias Económicas	NO
05		Instituto de Investigación en Ciencias Económicas	NO
06	Derecho y Ciencias Políticas	Instituto de Investigaciones Jurídico-Políticas
07	Educación y Ciencias de la Comunicación	Instituto de Comunicación y Educación en Población	NO
08		Instituto de Administración Universitaria	NO
09	Ciencias Físicas y Matemáticas	Instituto Interdisciplinario en Ciencia y Tecnología de Materiales	NO
10		Instituto de Investigación en Matemáticas	NO
11		Instituto de Investigación Física	NO
12	Ciencias Sociales	Instituto de Investigaciones Sociales	SI	Dr. Orlando Velásquez Benites
13	Enfermería	Instituto de Investigación en Enfermería
14	Estomatología	Instituto de Investigación Regional Estomatológico del Norte	NO
15	Farmacia y Bioquímica	Instituto de Investigación en Ciencias Farmacéuticas	NO
16	Ingeniería	Instituto de Investigación en Materiales	NO
17		Instituto de Investigación en Energía	NO
18		Instituto de Investigación en Automatización y Robótica	NO
19		Instituto de Investigación en Desastres y Medio Ambiente	NO
20	Ingeniería Química	Instituto de Investigación de Ciencias Químicas y Ambientales	NO
21	Medicina	Instituto de Oftalmología	NO
22		Instituto de Medicina Tropical	SI	Mg. Milagros Elizabeth Trujillo Neciosup
23		Instituto de Farmacología Clínica	NO
24		Instituto de Nutrición y Bioquímica	NO
25		Instituto de Investigación y Bioquímica	NO
26		Instituto de Investigación de la Madre y el Niño	NO